Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVB4

Slit3, Slit homolog 3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slit3Q9WVB4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Slit3Q9WVB4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Slit3Q9WVB4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC29.38■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Slit3Q9WVB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.3■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Slit3Q9WVB4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms