Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV31

Arc, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArcQ9WV31 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ArcQ9WV31 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ArcQ9WV31 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
ArcQ9WV31 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ArcQ9WV31 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms