Protein–RNA interactions for Protein: Q9WV27

Atp1a4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp1a4Q9WV27 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Atp1a4Q9WV27 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Atp1a4Q9WV27 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Atp1a4Q9WV27 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms