Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUU8

Tnip1, TNFAIP3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 647 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnip1Q9WUU8 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tnip1Q9WUU8 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tnip1Q9WUU8 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tnip1Q9WUU8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnip1Q9WUU8 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tnip1Q9WUU8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms