Protein–RNA interactions for Protein: Q9WUP7

Uchl5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L5, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl5Q9WUP7 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Uchl5Q9WUP7 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Uchl5Q9WUP7 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Uchl5Q9WUP7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms