Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Tnfsf13bQ9WU72 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Tnfsf13bQ9WU72 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.1 ms