Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Scnn1bQ9WU38 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Scnn1bQ9WU38 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Scnn1bQ9WU38 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Scnn1bQ9WU38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms