Protein–RNA interactions for Protein: Q9R233

Tapbp, Tapasin, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TapbpQ9R233 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
TapbpQ9R233 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
TapbpQ9R233 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
TapbpQ9R233 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms