Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P4

Psma1, Proteasome subunit alpha type-1, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma1Q9R1P4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Psma1Q9R1P4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Psma1Q9R1P4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Psma1Q9R1P4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 584.2 ms