Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0H5

Krt71, Keratin, type II cytoskeletal 71, mousemouse

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt71Q9R0H5 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt71Q9R0H5 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Krt71Q9R0H5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Krt71Q9R0H5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms