Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0G7

Zeb2, Zinc finger E-box-binding homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zeb2Q9R0G7 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Zeb2Q9R0G7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Zeb2Q9R0G7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Zeb2Q9R0G7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Zeb2Q9R0G7 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms