Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0C8

Vav3, Guanine nucleotide exchange factor VAV3, mousemouse

Predictions only

Length 847 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav3Q9R0C8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vav3Q9R0C8 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vav3Q9R0C8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Vav3Q9R0C8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vav3Q9R0C8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms