Protein–RNA interactions for Protein: Q9R059

Fhl3, Four and a half LIM domains protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fhl3Q9R059 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Fhl3Q9R059 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Fhl3Q9R059 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Fhl3Q9R059 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 906.1 ms