Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC19.95■□□□□ 0.79
CtsjQ9R014 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CtsjQ9R014 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 195.5 ms