Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZR0

Rnf25, E3 ubiquitin-protein ligase RNF25, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf25Q9QZR0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rnf25Q9QZR0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Rnf25Q9QZR0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Rnf25Q9QZR0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.5 ms