Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY76

Vapb, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VapbQ9QY76 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
VapbQ9QY76 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
VapbQ9QY76 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
VapbQ9QY76 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms