Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY40

Plxnb3, Plexin-B3, mousemouse

Predictions only

Length 1,902 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxnb3Q9QY40 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Plxnb3Q9QY40 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Plxnb3Q9QY40 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Plxnb3Q9QY40 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Plxnb3Q9QY40 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms