Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY31

Snai3, Zinc finger protein SNAI3, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snai3Q9QY31 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Snai3Q9QY31 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Snai3Q9QY31 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.6 ms