Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY30

Abcb11, Bile salt export pump, mousemouse

Predictions only

Length 1,321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb11Q9QY30 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Abcb11Q9QY30 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Abcb11Q9QY30 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Abcb11Q9QY30 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms