Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY14

Foxe3, Forkhead box protein E3, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxe3Q9QY14 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Foxe3Q9QY14 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Foxe3Q9QY14 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Foxe3Q9QY14 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 145.3 ms