Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Pcsk1nQ9QXV0 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Pcsk1nQ9QXV0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms