Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Kcnip3Q9QXT8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Kcnip3Q9QXT8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms