Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXN3

Trip4, Activating signal cointegrator 1, mousemouse

Predictions only

Length 581 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip4Q9QXN3 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Trip4Q9QXN3 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Trip4Q9QXN3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Trip4Q9QXN3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.5 ms