Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK7

Cpsf3, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf3Q9QXK7 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Cpsf3Q9QXK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cpsf3Q9QXK7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cpsf3Q9QXK7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cpsf3Q9QXK7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms