Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK3

Copg2, Coatomer subunit gamma-2, mousemouse

Predictions only

Length 871 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg2Q9QXK3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Copg2Q9QXK3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Copg2Q9QXK3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Copg2Q9QXK3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.4 ms