Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXE4

Trp53inp1, Tumor protein p53-inducible nuclear protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trp53inp1Q9QXE4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Trp53inp1Q9QXE4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Trp53inp1Q9QXE4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Trp53inp1Q9QXE4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 218.1 ms