Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Limd1Q9QXD8 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Limd1Q9QXD8 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Limd1Q9QXD8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.8 ms