Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWF0

Chaf1a, Chromatin assembly factor 1 subunit A, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chaf1aQ9QWF0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chaf1aQ9QWF0 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chaf1aQ9QWF0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chaf1aQ9QWF0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chaf1aQ9QWF0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms