Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUM4

Slamf1, Signaling lymphocytic activation molecule, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slamf1Q9QUM4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Slamf1Q9QUM4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Slamf1Q9QUM4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Slamf1Q9QUM4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.2 ms