Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Cln8Q9QUK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Cln8Q9QUK3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cln8Q9QUK3 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms