Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdkl2Q9QUK0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cdkl2Q9QUK0 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms