Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMG4

Nkain4, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain4Q9JMG4 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Nkain4Q9JMG4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nkain4Q9JMG4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nkain4Q9JMG4 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms