Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLV2

Trpc4ap, Short transient receptor potential channel 4-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc4apQ9JLV2 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Trpc4apQ9JLV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Trpc4apQ9JLV2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Trpc4apQ9JLV2 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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