Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLB4

Cubn, Cubilin, mousemouse

Predictions only

Length 3,623 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CubnQ9JLB4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CubnQ9JLB4 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CubnQ9JLB4 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
CubnQ9JLB4 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms