Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
AtrQ9JKK8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
AtrQ9JKK8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms