Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKJ9

Cyp39a1, 24-hydroxycholesterol 7-alpha-hydroxylase, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp39a1Q9JKJ9 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Cyp39a1Q9JKJ9 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cyp39a1Q9JKJ9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cyp39a1Q9JKJ9 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms