Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF7

Mrpl39, 39S ribosomal protein L39, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl39Q9JKF7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mrpl39Q9JKF7 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Mrpl39Q9JKF7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Mrpl39Q9JKF7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84 ms