Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJG7

Caln1, Calcium-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caln1Q9JJG7 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Caln1Q9JJG7 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Caln1Q9JJG7 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Caln1Q9JJG7 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms