Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF6

Efcc1, EF-hand and coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcc1Q9JJF6 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Efcc1Q9JJF6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Efcc1Q9JJF6 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Efcc1Q9JJF6 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Efcc1Q9JJF6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms