Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIS7

Cacna1f, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1F, mousemouse

Predictions only

Length 1,985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1fQ9JIS7 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cacna1fQ9JIS7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cacna1fQ9JIS7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Cacna1fQ9JIS7 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.6 ms