Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIF7

Copb1, Coatomer subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb1Q9JIF7 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Copb1Q9JIF7 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Copb1Q9JIF7 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Copb1Q9JIF7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Copb1Q9JIF7 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms