Protein–RNA interactions for Protein: Q9JI38

Pus3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus3Q9JI38 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pus3Q9JI38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pus3Q9JI38 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Pus3Q9JI38 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Pus3Q9JI38 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms