Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tcirg1Q9JHF5 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tcirg1Q9JHF5 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tcirg1Q9JHF5 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcirg1Q9JHF5 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcirg1Q9JHF5 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tcirg1Q9JHF5 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 140.7 ms