Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHB3

Timp4, Metalloproteinase inhibitor 4, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Timp4Q9JHB3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Timp4Q9JHB3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Timp4Q9JHB3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Timp4Q9JHB3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms