Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET43

Cldn12, Claudin-12, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn12Q9ET43 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Cldn12Q9ET43 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cldn12Q9ET43 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms