Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG4

Tmem27, Collectrin, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem27Q9ESG4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Tmem27Q9ESG4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem27Q9ESG4 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms