Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ52

Vmn1r48, Vomeronasal type-1 receptor 48, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r48Q9EQ52 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Vmn1r48Q9EQ52 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vmn1r48Q9EQ52 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vmn1r48Q9EQ52 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 239 ms