Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ropn1lQ9EQ00 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ropn1lQ9EQ00 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ropn1lQ9EQ00 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms