Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPU4

Cpsf1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf1Q9EPU4 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Cpsf1Q9EPU4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Cpsf1Q9EPU4 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Cpsf1Q9EPU4 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
Cpsf1Q9EPU4 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC29.45■■■□□ 2.3
Cpsf1Q9EPU4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms