Protein–RNA interactions for Protein: Q9EP97

Senp3, Sentrin-specific protease 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Senp3Q9EP97 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Vmn1r3-201ENSMUST00000105159 1011 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Gm43222-201ENSMUST00000199013 603 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Hormad1-201ENSMUST00000029754 1385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Senp3Q9EP97 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm19080-201ENSMUST00000196082 550 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 AC079680.1-201ENSMUST00000218730 649 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 AC129597.1-201ENSMUST00000223046 1234 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm14776-201ENSMUST00000121029 887 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Vmn1r-ps8-201ENSMUST00000177200 838 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 BC028528-201ENSMUST00000036360 752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm21739-202ENSMUST00000188917 933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm11008-201ENSMUST00000109032 622 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Sox5it-201ENSMUST00000144026 1207 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Vmn1r185-201ENSMUST00000171039 1144 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm3676-201ENSMUST00000111869 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm3476-203ENSMUST00000190582 612 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Gm37073-201ENSMUST00000192469 1222 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Senp3Q9EP97 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 1600019K03Rik-201ENSMUST00000187829 477 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Hprt-201ENSMUST00000026723 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 E130114P18Rik-201ENSMUST00000107067 1092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Smgc-203ENSMUST00000109276 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Hesx1-202ENSMUST00000224331 983 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 5033425B01Rik-201ENSMUST00000213948 1303 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Gm45462-201ENSMUST00000211267 792 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Ssxb3-201ENSMUST00000089374 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Msmb-201ENSMUST00000022464 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Prr9-201ENSMUST00000070284 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Senp3Q9EP97 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 123.7 ms